leria:centre_de_calcul:cluster
Différences
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leria:centre_de_calcul:cluster [26/03/2019 15:33] – [Array jobs] Chantrein Jean-Mathieu | leria:centre_de_calcul:cluster [06/07/2020 10:53] – [IMPORTANT: Disponibilité et politique de gestion des ressources] Chantrein Jean-Mathieu | ||
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Ligne 45: | Ligne 45: | ||
| Hostname | | Hostname | ||
| star[254-253] | | star[254-253] | ||
- | | star[245-244] | + | | star[246-252] |
+ | | star[245-244] | ||
| star243 | | star243 | ||
- | | star242 | + | | star242 |
- | | TODO star[199-195] | + | | TODO star[199-195] |
| TODO star[194-190] | | TODO star[194-190] | ||
==== Architecture logicielle ==== | ==== Architecture logicielle ==== | ||
Ligne 99: | Ligne 100: | ||
< | < | ||
+ | <note important> | ||
+ | https:// | ||
==== Slurm: premiers tests et documentation ==== | ==== Slurm: premiers tests et documentation ==== | ||
Ligne 254: | Ligne 257: | ||
Il est tout a fait possible de surcharger ces valeurs par défaut avec les options --mem-per-cpu et --time. Toutefois, | Il est tout a fait possible de surcharger ces valeurs par défaut avec les options --mem-per-cpu et --time. Toutefois, | ||
- | <note important> | + | <note important> |
+ | * vous ne devriez pas surévaluer les ressources de vos jobs. En effet, slurm fonctionne avec une notion de partage juste (fair share): si vous réservez des ressources, peu importe que vous les utilisiez ou non. Lors de vos prochaines soumissions, | ||
+ | * Si vous avez un grand nombre de job à faire, **vous devez utiliser la soumission par array job**. | ||
+ | * Si ces jobs ont de grandes durées d' | ||
</ | </ | ||
Ligne 276: | Ligne 282: | ||
Voir aussi [[leria: | Voir aussi [[leria: | ||
- | Le cluster de calcul utilise un pool de serveurs de stockages distribués [[https:// | + | * Le cluster de calcul utilise un pool de serveurs de stockages distribués [[https:// |
+ | * Si vous souhaitez créer des groupes, merci d' | ||
+ | |||
+ | * Pour rappel, **par défaut**, les droits de votre home sont définis à 755, donc **tout le monde peut lire et exécuter vos données**. | ||
===== Utilisation avancée ===== | ===== Utilisation avancée ===== | ||
Ligne 518: | Ligne 527: | ||
Par défaut, il est impossible de se connecter en ssh directement sur les nœuds de calcul. Cependant, si c'est justifié, nous pouvons facilement faire des exceptions si celles ci sont temporaires. Dans ce cas, merci de faire une demande explicite à technique [at] info.univ-angers.fr | Par défaut, il est impossible de se connecter en ssh directement sur les nœuds de calcul. Cependant, si c'est justifié, nous pouvons facilement faire des exceptions si celles ci sont temporaires. Dans ce cas, merci de faire une demande explicite à technique [at] info.univ-angers.fr | ||
+ | |||
+ | Les utilisateurs ayant un accès en ssh doivent être abonnés à la liste calcul-hpc-leria-no-slurm-mode@listes.univ-angers.fr. | ||
+ | Pour s' | ||
+ | |||
+ | __Règle par défaut:__ on ne lance pas un calcul sur un serveur sur lequel tourne déjà un calcul d'un autre utilisateur, | ||
+ | Exception pour les processus boinc. Ces processus se mettent en pause lorsque vous exécutez vos calculs. | ||
+ | |||
+ | La commande htop vous permet de savoir qui calcule avec quelles ressources et depuis combien de temps. | ||
+ | |||
+ | Si vous avez un doute, contactez l' | ||
==== Cuda ==== | ==== Cuda ==== | ||
Ligne 528: | Ligne 547: | ||
Ces nœuds sont pour l' | Ces nœuds sont pour l' | ||
- | |||
- | Listes des utilisateurs autorisés à se servir des nœuds gpu actuellement (en ssh): | ||
- | * benoit.damota | ||
- | * jean-michel.richer | ||
- | * o.goudet | ||
==== Nœud RAM ==== | ==== Nœud RAM ==== | ||
Ligne 538: | Ligne 552: | ||
Ce nœud est accesible par soumissions via slurm (partition ram). Pour pouvoir vous en servir, merci d'en faire la demande explicite à technique [at] info.univ-angers.fr | Ce nœud est accesible par soumissions via slurm (partition ram). Pour pouvoir vous en servir, merci d'en faire la demande explicite à technique [at] info.univ-angers.fr | ||
- | |||
- | Listes des utilisateurs autorisés à se servir des nœuds ram actuellement (en ssh): | ||
- | * benoit.damota (pour boinc) | ||
- | * gilles.hunault (pour test) | ||
- | |||
- | Listes des utilisateurs autorisés à se servir des nœuds ram actuellement (via slurm): | ||
- | * frederic.lardeux | ||
- | * gilles.hunault | ||
==== Cplex ==== | ==== Cplex ==== | ||
Ligne 557: | Ligne 563: | ||
user@stargate~# | user@stargate~# | ||
+ | |||
+ | * Que signifie "Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler" | ||
+ | |||
+ | Vous avez dépassé la limite de mémoire que vous avez fixé ou celle par défaut (paramètre --mem-per-cpu) | ||
* Comment obtenir un prompt shell interactif dans un nœud de calcul de votre partition par défaut ? | * Comment obtenir un prompt shell interactif dans un nœud de calcul de votre partition par défaut ? |
leria/centre_de_calcul/cluster.txt · Dernière modification : 06/06/2023 17:00 de Chantrein Jean-Mathieu