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leria:centre_de_calcul:cluster

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leria:centre_de_calcul:cluster [06/11/2020 15:12] – [Tableau] Chantrein Jean-Mathieuleria:centre_de_calcul:cluster [06/06/2023 17:00] (Version actuelle) – [Tableau] Chantrein Jean-Mathieu
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-<note tip>you can see the translation of this page by clicking on the banner of your language at the top right of this page</note>+^  [[technique:accueil#mots_cles|Mots clés]] | {{tag> "cluster de calcul" hpc stargate}} 
 + 
 +<note tip>You can see the translation of this page [[leria:centre_de_calcul:cluster_english_version|here]].</note>
  
  
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 ==== Architecture matérielle ==== ==== Architecture matérielle ====
  
-|  Hostname       |  Modèle      Nombre de modèle identique  |  GPU                Nombre de GPU/modèle  |  CPU                                                                                                                                                 |  Nombre de CPU/modèle  |  Nombre de cœurs/CPU  |  Nombre de threads/CPU  |  Nombre de threads/modèle  |  RAM      |  Espace de stockage local  |  Interconnection +|  Hostname            |  Modèle      Nombre de modèle identique  |  GPU                Nombre de GPU/modèle  |  CPU                                                                                                                                              |  Nombre de CPU/modèle  |  Nombre de cœurs/CPU  |  Nombre de threads/CPU  |  Nombre de threads/modèle  |  RAM      |  Espace de stockage local  |  Interconnection 
-|  star[254-253]  |  Dell R720  |  2                            Tesla K20m        |  2                      [[https://ark.intel.com/fr/products/75275/Intel-Xeon-Processor-E5-2670-v2-25M-Cache-2-50-GHz-|intel-E5-2670]]                                       |  2                      10                    20                      40                        |  64 Go    |  1To                        2*10Gb/        | +|  star[254-253]       |  Dell R720  |  2                            Tesla K20m        |  2                      [[https://ark.intel.com/fr/products/75275/Intel-Xeon-Processor-E5-2670-v2-25M-Cache-2-50-GHz-|intel-E5-2670]]                                    |  2                      10                    20                      40                        |  64 Go    |  1To                        2*10Gb/        | 
-|  star[246-252]  |  Dell R620  |  7                            X                  0                      [[https://ark.intel.com/fr/products/75275/Intel-Xeon-Processor-E5-2670-v2-25M-Cache-2-50-GHz-|intel-E5-2670]]                                       |  2                      10                    20                      40                        |  64 Go    |  1 To                      |  2*10Gb/        | +|  star[246-252]       |  Dell R620  |  7                            X                  0                      [[https://ark.intel.com/fr/products/75275/Intel-Xeon-Processor-E5-2670-v2-25M-Cache-2-50-GHz-|intel-E5-2670]]                                    |  2                      10                    20                      40                        |  64 Go    |  1 To                      |  2*10Gb/        | 
-|  star[245-244]  |  Dell R630  |  2                            X                  0                      [[https://ark.intel.com/fr/products/91316/Intel-Xeon-Processor-E5-2695-v4-45M-Cache-2-10-GHz-|intel-E5-2695]]                                       |  2                      18                    36                      72                        |  128 Go    X                          2*10Gb/        | +|  star[245-244]       |  Dell R630  |  2                            X                  0                      [[https://ark.intel.com/fr/products/91316/Intel-Xeon-Processor-E5-2695-v4-45M-Cache-2-10-GHz-|intel-E5-2695]]                                    |  2                      18                    36                      72                        |  128 Go    X                          2*10Gb/        | 
-|  star243        |  Dell R930  |  1                            X                  0                      [[https://ark.intel.com/fr/products/93806/Intel-Xeon-Processor-E7-4850-v4-40M-Cache-2-10-GHz-|intel-E7-4850]]                                       |  4                      16                    32                      128                        1500 Go  |  1To                        2*10Gb/        | +|  star243             |  Dell R930  |  1                            X                  0                      [[https://ark.intel.com/fr/products/93806/Intel-Xeon-Processor-E7-4850-v4-40M-Cache-2-10-GHz-|intel-E7-4850]]                                    |  4                      16                    32                      128                        1500 Go  |  1To                        2*10Gb/        | 
-|  star242        |  Dell R730  |  1                            Tesla P100        |  1                      [[https://ark.intel.com/fr/products/92986/Intel-Xeon-Processor-E5-2620-v4-20M-Cache-2-10-GHz-|intel-E5-2620]]                                       |  2                      8                    |  16                      32                        |  128 Go    1 To                      |  2*10Gb/        | +|  <del>star242</del>  |  Dell R730  |  1                            Tesla P100        |  1                      [[https://ark.intel.com/fr/products/92986/Intel-Xeon-Processor-E5-2620-v4-20M-Cache-2-10-GHz-|intel-E5-2620]]                                    |  2                      8                    |  16                      32                        |  128 Go    1 To                      |  2*10Gb/        | 
-|  star[199-195]  |  Dell R415  |  5                            X                  0                      [[https://www.cpubenchmark.net/cpu.php?cpu=AMD+Opteron+6134&id=1566|amd-opteron-6134]]                                                              |  1                      8                    |  16                      16                        |  32 Go    |  1 To                      |  2*1Gb/         | +|  star[199-195]       |  Dell R415  |  5                            X                  0                      [[https://www.cpubenchmark.net/cpu.php?cpu=AMD+Opteron+6134&id=1566|amd-opteron-6134]]                                                           |  1                      8                    |  16                      16                        |  32 Go    |  1 To                      |  2*1Gb/         | 
-|  star[194-190]  |  Dell R415  |  5                            X                  0                      [[https://www.cpubenchmark.net/cpu.php?cpu=AMD+Opteron+4184&id=278|amd-opteron-4184]]                                                               |  1                      6                    |  12                      12                        |  32 Go    |  1 To                      |  2*1Gb/         | +|  star[194-190]       |  Dell R415  |  5                            X                  0                      [[https://www.cpubenchmark.net/cpu.php?cpu=AMD+Opteron+4184&id=278|amd-opteron-4184]]                                                            |  1                      6                    |  12                      12                        |  32 Go    |  1 To                      |  2*1Gb/         | 
-|  star100        |  Dell T640  |  1                            RTX 2080 Ti        4                      [[https://ark.intel.com/content/www/fr/fr/ark/products/123540/intel-xeon-bronze-3106-processor-11m-cache-1-70-ghz.html|intel-xeon-bronze-3106]]     |  1                      8                    |  16                      16                        |  96 Go    |  X                          2*10 Gb/s        | +|  star100             |  Dell T640  |  1                            RTX 2080 Ti        4                      [[https://ark.intel.com/content/www/fr/fr/ark/products/123540/intel-xeon-bronze-3106-processor-11m-cache-1-70-ghz.html|intel-xeon-bronze-3106]]  |  1                      8                    |  16                      16                        |  96 Go    |  X                          2*10 Gb/s        | 
-|  star101         Dell R640  |  1 (Molltech)                |  X                  0                      [[https://ark.intel.com/content/www/fr/fr/ark/products/123550/intel-xeon-silver-4114-processor-13-75m-cache-2-20-ghz.html|intel-xeon-silver-4114]]  |  1                      20                    40                      40                        |  96 Go    |  1 To                      |  2*10 Gb/s        | +|  star101             |  Dell R740  |  1                            Tesla V100 32 Go  |  3                      [[https://ark.intel.com/content/www/us/en/ark/products/193390/intel-xeon-silver-4208-processor-11m-cache-2-10-ghz.html|intel-xeon-server-4208]]  |  2                      8                    |  16                      32                        |  96 Go    |  X                          2*10 Gb/s        |
-|  star102        |  Dell R740  |  1                            Tesla V100 32 Go  |  3                      [[https://ark.intel.com/content/www/us/en/ark/products/193390/intel-xeon-silver-4208-processor-11m-cache-2-10-ghz.html|intel-xeon-server-4208]]     |  2                      8                    |  16                      32                        |  96 Go    |  X                          2*10 Gb/s        |+
 ==== Architecture logicielle ==== ==== Architecture logicielle ====
  
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 Le chemin pour la bibliothèque Cplex est le chemin par défaut /opt/ibm/ILOG/CPLEX_Studio129 (version 12.9) Le chemin pour la bibliothèque Cplex est le chemin par défaut /opt/ibm/ILOG/CPLEX_Studio129 (version 12.9)
 +
 +
 +==== Environnements conda (Python) ====
 +
 +La commande **conda activate <env_name>**, permettant d'activer un environnement conda n'est pas utilisable avec slurm. À la place, il faut utiliser au début du script de lancement :
 +
 + source ./anaconda3/bin/activate <env_name>
 +
 +Il sera peut être également nécessaire de mettre à jour les variables d'environnement et d'initialiser conda sur le noeud de calcul :
 +
 + source .bashrc
 + conda init bash
 +
 +L'environnement restera alors actif d'une exécution à une autre. Pour le désactiver, il faudra utiliser :
 +
 + source ./anaconda3/bin/deactivate
 ===== FAQ ===== ===== FAQ =====
  
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   * Faire vous même l'installation via conda: [[https://www.anaconda.com/download/#linux|téléchargement]] et [[https://conda.io/docs/user-guide/install/linux.html|installation]]   * Faire vous même l'installation via conda: [[https://www.anaconda.com/download/#linux|téléchargement]] et [[https://conda.io/docs/user-guide/install/linux.html|installation]]
   * Faire vous même l'installation en compilant les sources dans votre home_directory   * Faire vous même l'installation en compilant les sources dans votre home_directory
-  * Utiliser docker ou singularity (TODO: pas encore disponible)+
  
 ===== Visualiser la charge du cluster de calcul haute performance ===== ===== Visualiser la charge du cluster de calcul haute performance =====
leria/centre_de_calcul/cluster.1604671954.txt.gz · Dernière modification : 06/11/2020 15:12 de Chantrein Jean-Mathieu